Προηγμένοι τρόποι ανίχνευσης του βακτηρίου της Ξυλλέλας

Μια διεθνής ερευνητική ομάδα, η οποία συγκροτήθηκε μέσω του ευρωπαϊκού έργου BeXyl – Beyond Xylella, σημείωσε σημαντική πρόοδο στη βελτίωση εργαλείων πρώιμης ανίχνευσης και παρακολούθησης του βακτηρίου Xylella fastidiosa. Η ομάδα, που συντονίζεται από τους Antonio Vicent (Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias) και Pablo Zarco-Tejada (University of Melbourne), επικεντρώνεται στη δημιουργία νέων, συνδυασμένων μεθόδων παρακολούθησης και έγκαιρης διάγνωσης της μόλυνσης στα φυτά και τα έντομα-φορείς του βακτηρίου.

Ανάμεσα στις μεθόδους που χρησιμοποιήθηκαν, η Μέθοδος Ανίχνευσης LAMP, η Ανασυνδυασμένη Πολυμεράση (RPA), η Ψηφιακή Αντίδραση Πολυμεράσης (ddPCR) και οι τεχνολογίες υψηλής ανάλυσης αληλλουχιών DNA  απέδειξαν την αποτελεσματικότητά τους σε δείγματα από αμυγδαλιές, αμπέλια, ελιές, καφέ και αβοκάντο. Ιδιαίτερα, η μέθοδος ddPCR παρουσίασε την υψηλότερη ευαισθησία, ενώ οι μέθοδοι LAMP και RPA είναι εξαιρετικά κατάλληλες για γρήγορη και επί τόπου διάγνωση, με ιδιαίτερη επιτυχία στις αμυγδαλιές. Αυτές οι τεχνικές, χωρίς πάντα την ανάγκη καθαρισμού του DNA πριν την ανάλυση, έδειξαν τη σύνθετη φύση του βακτηρίου μεταξύ των διαφορετικών φυτικών ειδών.

Επιπλέον, χρησιμοποιήθηκε μια διαδικασία εμπλουτισμού με δέσμευση αλληλουχιών (sequence-capture enrichment)  για τον προσδιορισμό του τύπου του στελέχους της Xylella fastidiosa, που αποδείχθηκε ότι αυξάνει την ευαισθησία στην ανίχνευση και τον τύπο κατά δύο τάξεις μεγέθους σε σχέση με την άμεση αλληλουχία του συνολικού DNA.

Αναζήτηση ασυμπτωματικών λοιμώξεων
Μέσω προηγμένων τεχνολογιών όπως η υπερφασματική απεικόνιση και η πλατφόρμα υψηλής απόδοσης για χαρακτηριστικά φυτών, οι ερευνητές μπόρεσαν να ανιχνεύσουν φυσιολογικά και δομικά χαρακτηριστικά που σχετίζονται με τη μόλυνση, πριν εμφανιστούν τα συμπτώματα. Χρησιμοποιώντας μοντέλα κατηγοριοποίησης, οι ερευνητές κατάφεραν να διακρίνουν τα μολυσμένα από τα υγιή φυτά ήδη δύο μήνες μετά τη μόλυνση, κάτι που δίνει τη δυνατότητα για έγκαιρη ανίχνευση και πρόβλεψη παρέμβασης.

Τηλεπισκόπηση για μεγάλης κλίμακας παρακολούθηση
Η παρακολούθηση μεγάλων περιοχών που πλήττονται από το βακτήριο παραμένει μια πρόκληση. Οι επιστήμονες επέκτειναν τις τεχνολογίες τηλεπισκόπησης μέσω αεροφωτογραφίας και δορυφορικών εικόνων που περιλαμβάνουν υπερφασματικά και θερμικά δεδομένα, προκειμένου να εκτιμήσουν την έκταση και τη σοβαρότητα της ασθένειας σε μεγάλες γεωγραφικές περιοχές.

Ανίχνευση από σκύλους 
Μια καινοτόμος προσέγγιση αποτέλεσε η χρήση σκύλων με εκπαιδευμένη οσφρητική ικανότητα για την ανίχνευση του Xylella fastidiosa. Οι δοκιμές έδειξαν εξαιρετικά αποτελέσματα στην ευαισθησία και την ακρίβεια, με τους σκύλους να ανιχνεύουν την παρουσία του βακτηρίου με μεγάλη επιτυχία. Αυτή η μέθοδος αναμένεται να ενισχύσει τη χρήση σκύλων για επιθεωρήσεις σε λιμάνια, φυτώρια και αγρούς.

Βελτιστοποιημένες στρατηγικές παρακολούθησης 
Η αποτελεσματική παρακολούθηση είναι το κλειδί για την επιτυχημένη διαχείριση επιθέσεων. Οι επιστήμονες του BeXyl ανέπτυξαν αναβαθμισμένα εργαλεία παρακολούθησης για την Xylella fastidiosa και τους φορείς της, χρησιμοποιώντας στατιστικά μοντέλα που βασίζονται σε γεωγραφικές και ατομικές μελέτες διάδοσης της ασθένειας. Οι στρατηγικές δειγματοληψίας που προσαρμόστηκαν στα δεδομένα που έχουν ήδη συλλεχθεί απέδειξαν ότι οι σειριακές και βάσει κινδύνου στρατηγικές παρακολούθησης μπορούν να ενισχύσουν την αποδοτικότητα και την αποτελεσματικότητα της παρακολούθησης.

Προς μια ολοκληρωμένη προσέγγιση
Τα αποτελέσματα του έργου BeXyl αποδεικνύουν ότι μια ολοκληρωμένη και επιστημονικά τεκμηριωμένη προσέγγιση για τη διαχείριση προσβολών της Xylella fastidiosa είναι εφικτή. Τα ευρήματα του έργου παρέχουν ρεαλιστικές και συμπληρωματικές επιλογές για την υποστήριξη των αρχών και των ενδιαφερόμενων φορέων στην αντιμετώπιση αυτού του σοβαρού κινδύνου για την γεωργία και τα φυσικά οικοσυστήματα.

Η έρευνα, που εντάσσεται στο πλαίσιο του έργου BeXyl, στοχεύει στη δημιουργία ενός ολοκληρωμένου μοντέλου παρακολούθησης και πρόληψης, που αποτελεί ένα από τα πιο επικίνδυνα φυτικά βακτήρια, με ικανότητα προσβολής πάνω από 700 ειδών φυτών, ανάμεσα τους και η ελιά. Το έργο χρηματοδοτείται από την ΕΕ και συνεργάζεται με περισσότερους από 30 εταίρους από τη βιομηχανία, την επιστήμη και τις δημόσιες αρχές.

Πηγή: bexylproject.org

Σχετικά άρθρα:

Αγροτικές Ειδήσεις: Κρούσμα καταρροϊκού πυρετού σε βοοειδή στην Πολωνία Πολιτική: Ο Μανώλης Κ. Κεφαλογιάννης σταθερός “πρεσβευτής” της νέας γενιάς της υπαίθρου μας από το 2014 Ενισχύει τη συνεργασία με Συνεταιρισμούς στη Λακωνία το Olive Legend Group – Ελαίας Καρπός Τροπική κυριαρχία για λάμψη και απολαύσεις μιας μπουκιάς στις 5 κορυφαίες τάσεις στα φρούτα το 2026 – Fresher